SEE-GRID-2 projesi Güney Doğu Avrupa Bölgesinde bilim topluluklarının ve son kullanıcıların eğitim ve araştırma ihtiyaçlarını karşılayan bir e-altyapıyı sunmayı amaçlayan ve Mayıs 2006 -2008 tarihlerinde gerçekleştirilen bir projedir. SEE-GRID projesinde ortaya çıkarılan altyapının ulusal ve bölgesel kapsamda operasyon ve genişleme düzeyinde sürdürülebilir olması temel hedeflerden birisi olmuştur. SEE-GRID-2 projesinde farklı disiplinlerin birlikte çalışmasını teşvik edecek bölgesel grid uygulamalarının desteklenmesine özel olarak önem verilmiştir. SEE-GRID-2 bölgesel işbirliği ve kararlılığının ortak olarak yapılan bilimsel çalışma ve e-Altyapı işletiminde son derece önemli olduğunu gösteren başarılı bir projedir. Projede:

yönünde çalışmalar gerçekleştirilmiştir. ULAKBİM'in proje ortağı ve iş paketi lideri olarak yer aldığı SEE-GRID-2 projesi kapsamında Bilkent ve Koç Üniversitelerinin geliştirdiği GPiP (Protein-Protein Etkileşimi Tahmini) uygulaması, Orta Doğu Teknik Üniversitesi'nin geliştirdiği GridAE (Grid Tabanlı Yapay Evrim) uygulaması, Boğaziçi Üniversitesi ve Kandilli Rasathanesi'nin geliştirdiği SDA (Sismik Veri Analizi) uygulaması desteklenmiştir.